牙狼动画版第二季改编自日本系列深夜特摄剧《牙狼》。动画版第二季将设定在日本平安时代，以女性版安倍睛明为主角，讲述她降妖伏魔的传奇故事……
健二和雪希是情同手足的兄妹两，日和是两人青梅竹马的好友，三人常常聚在一起打发空闲的时光，留下了十分美好的童年回忆。然而，某一天，日和突然不告而别，没有留下任何联系方式，也没有告诉健二和雪希自己要搬到哪里去。就这样，日和仿佛蒸发了一样从兄妹两人的生命轨迹中消失了，两人关于日和的记忆也随着时间的流逝而渐渐淡去。 一晃眼多年过去，健二和雪希都考上了高中，即将开始洋溢着青春气息的高中生活。一天，健二房间的衣橱里发出了奇怪的声音，让健二没有想到的是，打开衣橱后，里面躲着的竟然正是日和。和他的突然消失一样，日和突然回到了健二和雪希的身边。
当一个人面临人生中的重要选择之时，头上便会竖起旗帜，而表面看似平凡的少年旗立飒太（逢坂良太 配音），却因为一场意外而获得了能够看见这些旗帜的特异功能。某日，飒太转入了世界闻名遐迩的贵族学校私立旗谷学园，在这里，会发生怎样有趣的故事呢？ 傲娇毒舌的公主菜波（木户衣吹 配音），温柔内向的魔法泽茜（芽野爱衣 配音），高贵难以接近的圣帝小路美森（田村由香里 配音），成熟贤惠的青梅竹马召唤寺菊乃（阿澄佳奈 配音），英姿飒爽的盗贼山惠（花泽香菜 配音），在这些可爱女孩子们的包围下，一场有笑有泪的戏剧正式拉开了帷幕。
