童年时期的一个盛夏，女孩子面码（茅野爱衣 配音）死于意外。这件突如其来的死亡事件，深深刺痛了她的五个儿时玩伴——仁太、安鸣、雪集、鹤见子以及波波。六人组成的秘密基地“超和平Busters”就此解散，活着的五人带着无法弥补的创伤各自疏远各自长大。十年后，面码居然以一种只有仁太能看见的形式，带着一个想要实现的愿望回来了。 本剧场版从面码已经在五个伙伴的帮助下“成佛”讲起，在面码完成心愿消失一年后，仁太他们五人重聚，各自给面码写信，回忆去年夏天发生在“超和平Busters”六人身上的奇迹。
大都会平凡的一天，超人（马修·波莫 Matt Bomer 配音）以超凡的实力再次营救露易丝·莱恩小姐（斯坦娜·卡蒂克 Stana Katic 配音），当然他和叛逆的小表妹女超人卡拉（莫莉·奎恩 Molly C. Quinn 配音）以及露易丝之间的关系和烦恼同其他人相比没有任何差别。正在此时，不明物体坠入大气层。超人出面阻拦，却发现来者竟是一个凶恶的机器人。他轻松击败对手，似乎对这样的敌人不以为意，但卡拉心底的悲伤回忆却被勾起。原来当初氪星曾受到这种被称为布莱尼亚克机器人的代规模入侵，卡拉也被迫和父母分离。 意识到事态的严重性，超人必须想尽办法保卫地球，阻挡布莱尼亚克的入侵，但他同时面临最大的挑战……
