大唐玄宗年间，有一位神出鬼没的刀客出现在丝绸之路上，悄然守护着来往商队的安宁，人称“神风刀”。神风出，恶鬼哭。神风刀的大名据说连皇帝老儿都知道。奇怪的是，五年前，神风刀突然销声匿迹，再无音讯。有人说，他得罪了官家，被刺史府马队围杀了；有人说，他被逼无奈投靠了官军，再无颜面使用神风刀；还有人说，神风刀早变成了皇上的切菜刀。丝路上的商队对神风刀念念不忘。直到有一天，神风刀跟着一位少年再现江湖……
1961年春天，中国科学院上海生物研究所传开了一条震惊生物界的消息：世界上第一只没有外祖父的癞蛤蟆出世了，人工单性生殖实验成功了！就在大家都沉浸在喜庆的气氛中的时候，一个惊人噩耗又使人们陷入极度的悲痛。因为这项科学奇迹的创造者、著名的生物学家金昱曦博士，连自己的劳动成果都没有得及看一眼，就被癌症夺去了生命----他就是电《蛤蟆博士》叙述的主人公金昱曦。 金昱曦献身科学40年，走过了一条艰辛的路。1921年，他远涉法国勤工俭学，在那里做过翻砂工、修理工，织过地毯，洗过盘子。后来经人介绍给一位法国生物学教授当绘图员。由于他对生物学的酷爱，一开始工作就表现了特别的热情与勤奋，因此被冉克教授收为学生，留在身边。经过10年苦学，他获得了生物学博士学位。即将退休的老教授把金蝉曦看成自己理想的继承人，把自己工作了一辈子的实验室交给了这个前途无限的中国学生。1931年，日寇的铁蹄踏进了中国土地。远在异国的金昱曦思念家乡亲人，担心祖国的命运，他毅然放弃了优越的条件，告别了相处多年的老师，抱着科学救国的壮志，回到广州中山大学执教。黑暗的旧中国，科学上一片空白。最令金昱曦难以容忍的是反动政府利用伪科学进行反动宣传，愚弄欺骗人民。当他戳穿这群丑类的真面目的，却惹来了大祸，亲手搞起来的实验室，毁于警察的棍棒，回国几年成果的荡然无存。1935年，金昱曦带着妻子叶慧珍离开广州来到上海，继续他的研究。但是不久，上海沦陷，在日本人统治之下的这个东方大都市，更是鸡犬不宁。想出书，书店被封；想教书，人家会来找你的麻烦。这时汪伪南京政府派诸轶明找金昱曦去当汉奸，金昱曦当即严词拒绝。金昱曦走投无路，只得暂时放弃研究，在共产党人王书超的帮助下，全家躲进了偏僻的山区，在贫穷落后的山村里，教孩子们识字，帮老乡治蚕病。他靠着对人民的深厚感情，生活着；靠着对事业的信念，坚持着。不但生活了下来，并且还培养了两个忠实的学生：李鹓和叶嘉林。1948年金昱曦又回到了上海。他向私人借款，独自办起了生物研究所。黎明前的上海，通货膨胀，物价飞涨。贫困威胁着金昱曦。他的妻子叶慧珍既要帮助丈夫搞实验、绘图，又要承担4口之家的生活重担，终于在光明到来之前，她永远地离开了这个世界。解放了，金昱曦在巴黎的老同学 陈毅市长 找到了他，请他主持上海生物研究所的研究工作。他仅用了两年的时间把一直拖了18年的体外发育的实验做成了。但是，在极左路线的干扰下，金昱曦的基础科学研究又被迫停了下来。
一个拙劣的信仰治疗赋予了一个被欺负的少年超自然的萨满力量。 当他终生的折磨者搞出一个恶作剧杀死他所爱的人时，他用自己的力量进行报复，并开始血腥横冲直撞以解决问题。
本片讲述了3个孩子成长在不同的环境下，因为少年突如其来的家庭变故和生活困难偶然的成为朋友的故事…
