King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。 一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪一行去保护水晶王国，免受King Sombra的再度袭击。他们克服重重困难和阻挠，去保护水晶王国，并让那里再度恢复生机。
在人类生活的世界里，存在着另一个完全独立的平行世界纳尤古。纳尤古由拥有魔法的精灵师和精灵组成，他们将人类世界称之为“大方块”。10岁的小学生包小龙，大方块的一名小学生，然而他天生就有点不同，常常把老鼠、蟑螂等动物们看成可爱的小精灵。小龙的异常得不到家人的理解，更被同学和小伙伴们排斥。有一天，一颗粉红色的流星飞进了小龙的眼睛里，他开始听得到小精灵们的心声。精灵们不断涌现，惊呼小龙就是“那个人”黄金龙的精灵师。正当小龙迷惑不解时，他收到来自纳尤古齐格威精灵师学校尤达校长的信。
库特与直枝理树成为恋人，顺利结束修学旅行的另一个“Little jijikb.com Busters！”的世界。男生宿舍在翻修工程中发生漏水事故，导致宿舍无法继续使用。对于走投无路的理树，库特以“室友还在募集中…”为由伸出援手。就这样开始了和库特一起度过的暑假，这给他们带来了各种各样的新任务。理树和库特最后得到的东西是......？
第一部分：假面骑士Decade ～完结篇～ 骑士大战终于开始，世界的破坏者Decade将假面骑士们逐一打败。夏海为了阻止士而和KIVA-LA订下契约，变身为假面骑士KIVA-LA与Decade展开战斗。最终，KIVA-LA一剑刺穿了Decade……各骑士的世界恢复了原样，但Decade的世界却消失了。哀伤的众骑士一起回忆与士并肩作战的日子，而此时，过去的士从各人的回忆中复活！另一方面，超级死神博士与佐鲁大佐、蜂女共同组建超修卡，并制造出Neo生命体杜拉斯…… 第二部分：假面骑士W ～Begins Night～ 鸣海侦探事务所这次受“风都”人气歌手安纱美所托，负责调查安纱美亡姐突然出现的不可思议事件。在调查过程中，已去世的前所长鸣海庄吉竟然出现在翔太郎他们的面前，并变身为假面骑士Skull与之战斗。在与庄吉战斗的时侯，翔太郎逐渐回忆起庄吉逝去的那一夜，也是他与菲利普共同成为W的那一夜…… 第三部分：MOVIE大战2010 Decade与W命运般地相遇，并与全平成骑士一同对战超修卡的巨大要塞！
