在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
令和末期，日本因全球核战影响走向衰败，大量难民涌入，更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生，引发民众暴动，国家体制崩溃，人口锐减至原来的十分之一以下，文明水平倒退至明治初期，并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后，大和历56年，生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台，一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
故事发生在一座民风淳朴风景秀美的小镇之中，曾经，天空上出现的巨大黑色圆盘令人们陷入了恐慌之中，但除此之外大家的生活却并未受到实质性的影响，世界依旧在照常运转着，久而久之，人们渐渐习惯了被圆盘笼罩的生活。 古宫乃乃香（夏川椎菜 配音）跟随着父亲回到了曾经的故乡圆盘之街，在那里，乃乃香遇见了曾经的玩伴们。个性孤僻沉默寡言的户川汐音（小松未可子 配音）、活泼开朗的看板娘椎原小春（佳村遥 配音）、对圆盘的存在十分反感的水坂柚季（丰崎爱生 配音）和她的哥哥水坂凑太（石川界人 配音），当失落的回忆再度被记起，当告别的朋友们重新相聚，命运的齿轮开始了它的转动。
漫画20卷单行本限定OAD
经历过一期的绝赞好评后，《少女前线：治愈篇2》重磅来袭！唯美青春的校园生活，变幻莫测的荒野求生，光怪陆离的宿舍传说等等，以及最重要的：全新角色的闪亮登场！新角色新故事新段子新画风，更多惊喜尽在全新一季《少女前线：治愈篇2》！
大山武（前野智昭 配音）即将进入天日学园就读，在这所由女子学校改制而来的综合学校中，由其喜爱女孩子胸部的大山感到如鱼得水。在天日学园里，除了每天要学习的文化课程外，同学们还要学习掌握运用“元素”的技巧，其中格外有天赋者，则能够获得试用“魔具”作为武器的特殊能力。 个性傲娇的青梅竹马天谷春恋（下屋则子 配音），率真坦诚的栉八稻穗（野水伊织 配音），桀骜跋扈的姬神木灵（矢作纱友里 配音），在繁忙又惊险的学习生活中，大山和这些可爱的女孩子们之间产生了坚实的友谊。而随着能力的逐渐提升，大山发现，他们似乎被卷入了一场声势浩大的战争之中。
讲述在浮游城“艾恩葛朗特”从第一层开始往上攻略的故事。
