千早瑠依（古川慎 配音）和千原狮音（山本和臣 配音）是一对好朋友，两人常常结伴去搭讪女孩，因为他们英俊的外貌，搭讪行动大概率会以成功收场，这令两个男孩感到非常的骄傲。一天，狮音和往常一样，在海滩上释放他的费洛蒙，哪知道一个神秘的女人一直在暗处偷偷的盯着他。 神秘女人给狮音下了药，令狮音成为了女孩子。狮音绝望的得知，他必须吸收男子的精华，才能够重新恢复男儿身，可如果恢复男儿身的他损失了一定数量的精华后，他将再度变回女孩。很快，瑠依就知道了狮音的秘密，哪知道，这个离谱的男人竟然对变成了女儿身的好友垂涎欲滴。
这是五十年后的未来，世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而无效化下，生化科技企业“芬里尔”成功利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此，人类终于获得了与荒神对抗的力量。 于是，追求知性之极致的荒神，与追求物种延续的人类之间的战争便此展开。在破灭的尽头，究竟是神会先成为人，还是人会先成为神呢？竞争开始了。GOD EATER的任务是把靠近地下居住区的荒神击退，并且把荒神的核心和素材带回。在这样的背景下，玩家将会扮演一名神机使，开始了与死亡擦身而过的每一天。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
魔法世界，托里斯特因魔法学院，年轻人在这里学习魔法课程。 刚刚升入2年级的少女露易兹•德拉•瓦里埃尔因为一直以来施法成功率为0，被大家戏称为“零之露易兹”，她每次施法都无法成功，反而引起爆炸，把学院正常的学习生活搞的一团糟。 这一天，是魔法师一生一次的使魔召唤仪式，召唤的使魔将会与魔法师永远在一起。其他学生都顺利完成了使魔的召唤，而露易兹咒语一出，毫无意外的发生了爆炸。不过，露易兹还是召唤出了一个使魔——一位人类！东京的少年才人竟然来到了魔法世界，并被当作一位使魔！ 不知所措的才人与不把才人当人看的露易兹签订了契约，在这个魔法学院，东京的普通少年才人，他的命运会怎么样呢。
