在科技发达的未来，网络上流传着一种真假不明、被称为“全息幽灵”的奇怪现象。 初中一年级的天之河宙，启动了父亲留下的“数码暴龙机”开始能看到大家看不见的未知生物“数码宝贝”......
花果山同时诞生了孙悟空和六耳两只神猴，两人分头学艺，然而六耳归来的时候，孙悟空已经被天庭压在了五行山下，六耳为救孙悟空和天庭战斗，花果山一片战火。关键时刻孙悟空冲破了五行山的束缚，兄弟二人共同战斗。
