故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
竟然不慎穿书，还穿到了满头死亡flag的恶毒女二？ 不行，这个死亡flag，我一定要逃！什么！偏离人设，系统强制操纵执行！ 宁依仰天长啸天道不公，只能躺平，却发现触碰某人竟然能破除系统强制操纵！那个某人还是个大反派！ 可喜可贺，为苟命，管你正派反派，这大腿我抱定了！ 系统：警告警告！你已严重偏离人设！ 宁依：闪开！姐要开始逆袭了，这炮灰谁爱当谁当！
故事設定在《CODE GEASS 反叛的魯路修》的四年後 講述了兩名以高超的武藝廣為人知的傭兵，亞修和羅瑟的故事
阿斯特拉艾亚的山丘上，建有三家女子学校。圣米雅特尔女子学园（圣ミアトル女学园）、圣斯毕卡女子学院（圣スピカ女学院）、圣露·莉姆（圣ル·リム女学校）女子学校。而且，在那片土地的尽头是三家学校共用的宿舍----草莓宿舍。阿斯特拉艾亚的山丘…那里是不允许男子踏入的神圣领域…
因为某些事情而被编入圣米雅特尔女子学园四年级（由于初高中统一教育，其实相当于高中1年级）的渚砂心中充满了对新校园生活的期待与不安。
在入学第一天与所有人都憧憬的“Etoile”（法语中为“星星”的意思。艾特瓦尔是作为管束3校的学生会一切的存在，在3校的学生中位于至高点具有无比的权利与威望，与此同时也负担着沉重的责任与义务）的花园静马相遇。在被其美貌深深吸引的瞬间，身体不由自主地无法动弹了。另一方面，静马温柔地注视着如此的渚砂，并伸出双手渐渐靠近渚砂的脸庞，然后…！
年级和学校各不相同却蕴含各种各样回忆的只有少女的百合校园生活。在如此秘密的花园中发生的事情，你是否也来窥探一下…
