1989年,日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年,DIO复活了。同时,乔瑟夫的孙子,空条承太郎发现自己有幽波纹(替身)能力,DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲,陷入病危情况;为了拯救命在旦夕的母亲,承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
The Octopod is grabbed by a colossal squid. The Octonauts are unable to break free due to the hooks on the ends of the squid's tentacles. Fortunately the arrival of some sperm whales turns the squid from hunter to hunted.
在某个时间点的日本,突然出现了文学书全部被染黑的怪异现象。 这是由书中带着负面情绪诞生的“侵蚀者”所导致的灾难。 被侵蚀的文学书,会逐渐地从人们记忆中消失,最后变得像是从一开始便不曾存在过一样。 于是,有特殊能力的“炼金术师”作为特务司书被派遣至图书馆, 为了对抗破坏书 中世界的“侵蚀者”、为了守护文学,与转世的文豪们一起战斗。
作为最底层职业【鉴定士】出生的艾因一直过着最底层的生活。 在一次冒险中,遭遇大量地狱猎犬,同伴为了活命而把艾因当做了诱饵。 本因就这么结束生命的艾因遇到了她,从此艾因的命运发生了巨大的变化。