平凡的中学二年级少年影山茂夫，因其微弱的存在感而遭人戏称为“路人”，但不起眼的他其实是强大的天生超能力者。
与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
高中毕业之后，北原伊织（内田雄马 配音）顺利的进入了大学，即将展开崭新的大学生活。为了上学，北原来到了一座坐落在海边的城市里，和内陆城市完全不同的海洋气候使得北原对未来的生活充满了憧憬和希冀，同时也使他开始接触潜水这项有趣的运动。 个性活泼开朗略微有些强势的古手川千纱（安济知佳 配音）、温柔体贴实际上对妹妹千沙充满了强烈的占有欲的古手川奈华（内田真礼 配音）、时常顶撞北原但其实对哥哥充满了兴趣的傲娇少女北原栞，在这里，北原很快就结识到了一帮志同道合的好友们。加入了潜水部的北原，又会在这项运动中找到怎样的意义呢？
故事发生在21世纪的凤天市，讲述主人公安小武、元飞飞、白羽、周豪、金昊、陈默等人的战卡机因意外导入R程式程序而被激活，由此开始了风靡全国的关卡战馆比赛。在越来越激烈的战馆通关过程中，反派BOSS黑战神的野心逐渐浮出水面，小武等人通过智慧、团队合作、勇气、自信，一步步克服困难，最终战胜了黑战神，守护了战卡世界和大家的梦想。
為了尋找掉落魔脊山山谷的婁震戒以及七殺天凌的行蹤，殤不患等人在谷底進行搜索，卻誤入了生長著奇特植物的廣闊洞窟。 懷抱著復活魔神的野心卻遭受阻撓的妖女・刑亥，與西幽的邪教門派「神蝗盟」聯手，再次布下天羅地網，阻擋在凜雪鴉與殤不患面前！
