在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
美雪（上野树里 饰）收到朋友的邀请函，邀请去“废墟之乡”小度周末，美雪喊上同学和青梅竹马的金田一（龟梨和也 饰）一同前往，临时被同学放鸽子，变成了2人独行。在废墟之乡的一家旅馆，同住的还有警察剑持（加藤雅也 饰）、摄影师、小说家、医生等几个人，旅馆员工凑青子温柔大方，旅馆老板在饭后给大家讲了当地流传的吸血鬼的故事。 50年前，这里搬来一户罗马尼亚人，被大家误以为是吸血鬼，村民放了一场大火，事后却没找到儿子的尸体，从此天天有人死于吸血鬼之口。50年后，一家三口搬到这里开了旅馆，经济泡沫导致破产后夫妇自杀，剩下的一个女儿6年前神秘死去，身上的血都被抽干了。 故事讲到这里楼上传来惊叫声，一名女子死去，美雪恰好是事件的目击者，次日又一而再再而三有人死去，所有的矛头都直指美雪，一直逃避侦探爷爷大名的金田一，为了保护最重要的人，决定找出案件的真相。
