宫藤芳佳于人类的防卫线“第501统合战斗航空团”入伍！……但是，重要的敌人·内洛伊迟迟不来。于是大家过着非战斗，而是忙于做饭洗衣的日常。有时被充满个性的队员们折腾，有时会吐槽，有时做后援，如此的芳佳和愉快的魔女们的奇怪日常就此开始！
遥远未来，世界人口数在迎来巅峰后，开始呈现下降的趋势。人类为了让物种繁荣存续，制作出管理生态系的AI，并执行「人类多样化实验」。常人、兽人、魔族等经过遗传因子改造诞生的「多样人种」，在环绕高壁的生活圈之中，打造出被称作「CLUSTA」的「多样城镇」。有着丰富人口的「CLUSTA」，在各地都有不同的文化发展以及适合在地生活的人类居住。 为了不面临灭绝，人们都在AI的管理下度日──。
该片围绕活泼可爱的螺丝钉展开故事。
数百年前，欲望催生了几乎灭绝人类的玛娜生态。人类瞬间沦为猎物，文明毁灭殆尽，末日中猜忌和恐惧拉开了人与人之间的距离。灾难当前，人们逐渐意识到：情感——这个被灯塔视为禁忌的存在，如今成为突破一切障碍、构建命运共同体的最强纽带。已被逼至绝境的幸存者们能否重夺未来?
