十万年前，天岚宗叱咤修真界，宗内弟子皆是天骄，所向披靡。唯独开山弟子徐阳一直是炼气期，为突破修为早日飞升，徐阳闭关万年。谁知出关时，修真界已经没落，天岚宗也只剩三五弟子，眼见就要灭宗，徐阳击退强敌，誓要带领天岚宗重回巅峰！ 随着天岚宗势力扩大，徐阳修为停滞的真相也一步步的揭开，万年间，一个贯穿人、魔、仙三界的隐秘也展现在众人面前！究竟是一念成神，还是一念成魔？世界的生死就在徐阳的股掌之间！
动画剧情舞台为2047年，与人类之敌「D2」对抗而荒废的美国。指挥家「朝雏タクト」与「Musicart」的少女「命运」，在失去音乐的世界中各自为了自身的渴望，共同出发前往纽约。
小学时期，游泳部的四名成员在毕业前的游泳比赛中夺冠，之后他们毕业的毕业，出国的出国，四人分道扬镳。时过境迁，就读岩鸢高中的七濑遥（岛崎信长 配音）和好朋友橘真琴（铃木达央 配音）升上高二，他们与昔日的游泳部成员之一叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部，经过多番努力后，终于招募到了新成员龙崎怜（平川大辅 配音），他们以县大赛冠军为目标，进行紧张的集训。另一方面，凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定，要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部，在这个夏天，开始了关于友情与青春的Free!故事。
