随着友哈巴赫攻入灵王宫，死神与灭却师展开了最终决战。灵王陨落，现实世界随之崩塌。昔日的宿敌联手突入已发生异变的宫殿，共同迎战威胁万物存续的危机。
羊狼意外误入奇幻山海界，邂逅众多上古奇兽，开启一场惊险的跨界冒险。旅途危机四伏，众人凭借彼此的默契协作，一次次化险为夷，逐步探寻隐秘的真相，厘清过往尘封旧事。没想到更大的危机步步逼近。最终羊狼携手伙伴同心协力，迎战强敌，打响守护山海界的最终决战。
故事发生在明治四十年（1907 年）在京都伏见居住的百川稻子什么都不擅长，每天都被父亲责骂，对于她来说的救赎就是祈祷神佛，某天一如往常她前往伏见稻荷神社参拜神明，遇到了一位自由奔放的少年坂本喜八，坂本喜八对稻子说不要信这些看不见的东西，从今之后将是电气时代。而此时稻子的 父亲对稻子说了关于结婚的事情，而且是父亲单方面决定的，稻子本来是放弃抵抗认为自己的价值就是如此，但坂本喜八打开了稻子想要离开这个家的心声，带着稻子离开了这个封闭的家。阻止结婚的方法是找出奇书《二十世纪电气目录》，那是喜八童年时代写下的关于电气的预言书，而喜八过去的哥哥清六带走这本书之后下落不明，喜八和稻子为了寻找这本奇书在京都和滋贺等地逃窜，消失的“电气目录”和其背后隐藏的秘密都等待揭开。
洛离从⼩被困于⽆灵之地银州⼤陆，成为天绝杀堂的第⼀杀⼿。⽗亲慈云⼤师牺牲⾃⼰为洛离换来⼀线⽣机，让其逃离银州，前往中天主世界去寻找真正的修仙之路。
TVアニメ『青の祓魔師 島根啓明結社篇』の続編を描く、『青の祓魔師 雪ノ果（ゆきのはて）篇』2024年10月放送決定！
