学園ヴァンガード！？ この物語の主人公・先導アイチが葛木カムイ、戸倉ミサキとチームを組みVFアジアサーキットを制してからはや数か月・・・中学生だったアイチは高校生になっていた。 アイチの通う学校は優秀な生徒たちが集まる名門として知られる宮地学園高等部。ヴァンガードを介して友達となった森川カツミや井崎ユウタといった同級生たちは別の高校に進学し、アイチは孤独な環境で高校生活をスタートする。 入学した当初は慣れない環境に戸惑ってばかりのアイチだったが、馴染みのカードショップ「カードキャピタル」の仲間である櫂トシキや三和タイシたちのアドバイスを受け、学校生活を充実させるため、アイチは学校にヴァンガードをする部活「カードファイト部」を作ろうとする。
自从姐姐莫名自杀之后，失去了所有亲人的皋月驱（小野大辅 配音）便彻底封闭了自己的心灵，虽然有着亲梅竹马水奈瀬由佳（后藤麻衣 配音）和养父母的关怀和照顾，但驱的生活再也无法恢复从前的单纯和快乐。一次偶然中，驱与由佳被传送到了一个天上有一轮红色月亮的异世界，在这里，他们成为了一些外形可怖的怪物的猎杀对象。好不容易死里逃生回到原来世界的驱发现，那个被称为“赤夜”的时空正在慢慢侵蚀正常的世界。 共有七人被卷入“赤夜”战争，他们的共同点便是均为绫女丘市虹绫馆学园的学生，为了生存，为了查明事件的真相，也为了保护自己所爱的人们，这命运选定的六人必须齐心协力，共同战斗。
目が覚めると、そこは見知らぬ森だった。 どうやらここは俺の知らないファンタジー世界らしい。 周囲を見渡せば、おっかない異形の魔獣だらけ。自分の姿を見てみたら、そこには…・・・って、オイ！ 俺、卵に転生したっていうのかよっ！？ 進化先にドラゴンとはあるものの、そもそも卵から孵るには魔獣を狩ってLVを上げなきゃいけないっぽい。 戦うなんて絶対無理！だって俺、卵じゃああぁああああん！！ なんとか進化はできたものの、せっかく出会えた人間からは“モンスター認定”される始末。 俺はただ、人間と仲良くなりたいだけなんだよおおおおお！！ いつだって絶体絶命！
主角大狼十三自小被组织捡养，并成为传说级杀手。某次任务中，他遭到神秘生物兵器刺中，竟意外变回中学生的模样，从此开始了国中生活……
