机动战士高达SEED的系列作再开。这次除了我们大家熟悉的基拉（保志总一朗 配音）、阿斯兰（石田彰 配音）等人外，还有大量新角色的登场。而故事也将演变的更为复杂，冲突加剧，战争升级。 C.E.70年2月，“血染情人节”事件的辐射效应还在地球联合军和ZAFT中延续着。二者发动了数次对抗，伤及众多无辜百姓。C.E.71年6月，地球联合军居然不顾条约发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。这让少年真飞鸟（铃村健一 配音）在一瞬间失去了自己全部的亲人，而且都是在自己眼前。这件事对飞鸟的打击不小，让他这个无忧无虑的平凡少年，决定加入ZAFT。加入ZAFT，飞鸟遇到了许多挫折和坎坷，也看到了人性的残忍和无奈，最严峻的情况是自己内心始终笼罩着家人离去的阴影。飞鸟的成长在ZAFT正式开始。他和基拉、阿斯兰他们又会有怎样的交集呢？
星嘉在决斗中战败，在他坠落地球的时候，不但失去了所有的记忆，还变成了一个幼小的孩子。而地球上的人们正在遭遇一场史无前例的能源危机，他们不知道的是，随着星嘉降落到地球上的，还有一块蕴藏有无尽能量的能源石。 十年过去了，在这十年的成长中，星嘉认识了夏吉、小哥、混混、晃晃等伙伴。而这一天，爱迪生忽然出现在地球上，为了要解开星嘉身为超能星人的秘密，他化身成神龙学院的饭糕博士，把星嘉和他的伙伴们引入一场空前的危机，希望借此激发星嘉的超能力，然后夺取超能星人星嘉身上所蕴藏的能量。 最后在和爱迪生的对决中，星嘉被夏吉还有卢娜的友谊打动，放弃了自己外星人的身份，愿意为了守护地球的和平与邪恶作战。而夏吉在最后关头终于领悟了八卦之术的最高境界，两位好兄弟携手并肩，最终挫败了爱迪生的阴谋。
这个世界是存在异人的。刚刚接触异人世界的张楚岚，加入了管理异人的组织“哪都通”。为了解开爷爷和自身的秘密，张楚岚和冯宝宝一起前往龙虎山天师府参加异人界的盛会——罗天大醮，并与众多异人高手对战。
