《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
悍娇虎（凯瑞·华格伦 配音）少女时候跟着师傅（达斯汀·霍夫曼 配音）辛苦练功，却始终无法得到师傅的认可。终于有一天，强敌野猪来袭，打败了一众高手，几乎无人能敌。混血大师被击败后来到翡翠宫找师傅，希望师傅能阻止野猪，于是师傅答应接受挑战。可是就在比武的前几天，师傅因为吃了阿波（杰克·布莱克 配音）做的饭而食物中毒无法应战，无奈之下指派悍娇虎带着卷轴去寻找神奇四侠，一连串的巧合之下，悍娇虎带回了快螳螂等人，自此故事发生了逆转……
这是一个人鬼混居的世界，鬼通过附身在人身上的方式来达到抵达现世的目的。能够从鬼手中保护人类的，是可以穿上动力服“铠”的战士们，动力服融合了古代秘术与最新的科技，拥有强大的力量。 三轮翔（野田雄大 配音）本是平凡的男子高中生，心中充满了正义感，还有对于英雄的憧憬。在误打误撞之中，翔穿上了动力服，并且加入了和鬼进行战斗的小队之中。在那里，翔结识了拥有将鬼送往异世界的能力的女巫明神逢花（茉白实步 配音）、世世代代守护女巫一组的“忍者”服部凉（水上翔斗 配音）以及同样拥有与鬼交战的能力的女生成濑枫（坂崎绘理 配音）等人。
睦悟郎是个热爱动物、心地善良的青年，却总是遭遇不幸 公司倒闭、弄丢钱包、连走在路上都会撞到招牌…彷彿全世界的霉运都降临在他身上！某日，睦悟郎巧遇一个占卜师，人生从此由黑白变彩色！ 当睦悟郎回到家里，竟然有三个可爱的美少女迎接他！这三名自称为小兰、小翼与久留美的女孩，其实是悟郎过去饲养的金鱼、鸚鵡和黄金鼠。牠们在死后为了报恩，以人类的姿态现身，成为悟郎的守护天使，也开始了悟郎另一种苦难日子……
