日本各地出现了异空间「魔都」── 由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力， 因此便由女兵组成了「魔防队」。 某一天， 过着抑郁生活的男高中生──和仓优希 不小心闯进了突发性产生的魔都入口， 在那里，遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香， 而她竟向优希宣言：「我要你当我的奴隶。」
竟然不慎穿书，还穿到了满头死亡flag的恶毒女二？ 不行，这个死亡flag，我一定要逃！什么！偏离人设，系统强制操纵执行！ 宁依仰天长啸天道不公，只能躺平，却发现触碰某人竟然能破除系统强制操纵！那个某人还是个大反派！ 可喜可贺，为苟命，管你正派反派，这大腿我抱定了！ 系统：警告警告！你已严重偏离人设！ 宁依：闪开！姐要开始逆袭了，这炮灰谁爱当谁当！
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年—— 拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明—— 从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！ 前所未闻的创世冒险谭，就此开幕！
