全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
击败青城晋级决赛的乌野，白鸟泽成为他们的下一个对手。
人类小女孩可可偶然穿越来到了月球一个叫做梦月乐园的地方。在这里，她结识了一群活泼可爱、个性迥异的梦月精灵，并在国王的请求下当了梦月精灵们的精灵导师，赋予魔法，教导小精灵们学习和成长，承担起解除危机拯救梦月乐园的重任。在可可的领导下，小精灵们懂得了许多道理，也学会了许多技巧和道理，在轻松、愉快的气氛中，可可、艾梦等小精灵一起成长，成为了朋友。 随着时间的推移，秘宝一件件被找到，传说中的危机也将渐渐浮出水面，或许有一天，可可和艾梦会面临更大的挑战，那时，她们将勇敢、坚强上网带领梦月精灵们共同守护梦月乐园。 该片以唯美的画面、细腻的感情，被称赞颇具日本动画名人宫崎骏的风范。该动画找到科幻和现实的对接点、共同点，用较为娱乐、轻松、活泼的方式演绎科幻的魅力。
故事依旧围绕斗龙战士的冒险、友爱、热血的战斗精神展开叙述，通过宝贝龙拍档和原始恐龙之间的经历和磨炼，以及斗龙战士之间的情感变化，多角度的弘扬斗龙精神，让孩子们体会成长中遇到的挫折和变化，让人类向原始恐龙学习来自原始恐龙世界的美德，共同为创建人类更美好的未来而努力。
