故事以江户时代后期为舞台，最强死刑犯忍者「画眉丸」为了能再次与最爱的妻子见面，与处刑人「山田浅右卫门佐切」一同前往被称为极乐净土的小岛，找寻「不老不死的仙药」以换取无罪释放，并在岛上与神秘的怪物以及其他死刑犯互相残杀。
因为在风祭流传着未确认生物的情报，以及超自然的现象之类的似真非真的传闻。瑚太朗向超自然研究会的部长，千里朱音的求助，于是展开了涉及到瑚太朗认识的学生们的调查。对于瑚太朗来说，原本只是抱着一点冒险心态而已。只要能和热闹的伙伴们一起度过的话，这样就足够了。但瑚太朗还没有注意到，他将要探求那无人知晓的“真实”。
打开通往异世界的大门后，天上优夜获得超强能力，脱胎换骨变成完美无缺的少年。在两个世界往返的他，「无自觉的外挂能力」愈来愈强大──!? 在异世界的洞窟里，他找到一本『贤者之书』，因此继承了传说贤者的超魔术。最强的体能再加上高强的魔术，他在异世界的进化简直没有极限... 现实世界当中，王星学园展开了校外教学！优夜活跃的表现陆续迷倒同年级的少女们，但是各方面都是顶尖水准的他不以为意，继续走自己的路！少年升级的脚步停不下来，全世界人类都将为他震惊──!!
传说中灵熙国的麒麟鼎能让人奇力倍增，众羊狼携皓月及力将军慕名而至。不料奇力没增成，喜羊羊却意外卷入风波生命垂危，为救喜羊羊，众守护者在灵熙国展开了大营救，到底有怎样的危机等着大家呢，喜羊羊又能否化险为夷，且看大营救系列第三部。
