清水凑（上村祐翔 配音）曾经是一名水球运动员，但由于一场意外的发生，导致他在初中三年级的时候决定放弃水球这项深爱的运动，升上高中后，凑在阴差阳错之下结识了名叫冈荣太郎（西山宏太朗 配音）的男生。荣太郎是凑曾经的校友，因此十分了解凑身上所发生的那些悲惨的故事，亦十分向往能够和凑就读同一所高中。 城岛让（木村昴 配音）是水球社的社长，在他的苦心劝说之下，凑终于同意了加入水球社。曾经是游泳能手的网滨秀吾（齐藤壮马 配音）、个性十分容易冲动，大大咧咧的江尻武一（古川慎 配音）、温文尔雅性格平和的猪俣巴巴亚罗丰（畠中祐 配音），在学校里，凑很快就交上了朋友，也重新拾起了对于水球运动的热情。
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥（田村由加莉 配音）、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵（能登麻美子 配音）、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃（钉宫理惠 配音），活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友，过着平凡的校园生活，但每当夜晚来临，她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标，是寻找价值连城的天使像，邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它，企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人（桧山修之 配音）、随叫随到的万能管家长月平之丞（清川元梦 配音），是他们在背后默默的支持着少女们。
该季将集中塑造瓦坎，讲述黑豹兄妹与自己的老敌人“影子内阁”斗争的故事。
这是一个设定在乡村场景下，却属于我们所有人的童年故事。剧情贴近真实的社会背景，既有现实生活中普通人的希望和追求，也有他们的焦虑和苦恼。在快速发展的工业化、城市化进程中，中国的城市和农村发生了翻天覆地的变化，也随之出现了很多新的社会问题。故事中许多社会现实背景，包括城市教育问题带来的普遍焦虑、自然缺失、乡村教育现状、留守儿童、移动互联网发展、新农村建设等等，都构成了作品中小主人公们的活动场景。剧情内容围绕中国孩子的童年故事，引发孩子和大人的情感共鸣。人们的日子过得越来越红火，可是乡村不再平静，不管大人还是孩子，每个人都需要重新适应环境，不断成长。
