冰川小雪是一位内向的学生，她总是向外筑起一道高高的心墙，只跟儿时好友安昙美姫互动。有一天，名叫雨宫凑的男孩，没来由地开始试图打进小雪的心房，扰乱了她平静的生活。孤僻的小雪、受欢迎的美姫、没有边界感的凑和散漫的篮球员阳太，一起共度尴尬、偶有挫折却很充实的学生生活。一段由青春交织而成的群像剧即将展开。
这是五十年后的未来，世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而无效化下，生化科技企业“芬里尔”成功利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此，人类终于获得了与荒神对抗的力量。 于是，追求知性之极致的荒神，与追求物种延续的人类之间的战争便此展开。在破灭的尽头，究竟是神会先成为人，还是人会先成为神呢？竞争开始了。GOD EATER的任务是把靠近地下居住区的荒神击退，并且把荒神的核心和素材带回。在这样的背景下，玩家将会扮演一名神机使，开始了与死亡擦身而过的每一天。
故事发生在桃园高中之内，加贺良介（下野紘 配音）是学校里出了名的好色之徒，对美少女的一切都十分热衷。某日，良介偶遇了名为丽萨菈（远藤绫 配音）的神秘女子，其真实身份竟是出身名门的死神，在阴差阳错之下，良介和丽萨菈签订了契约，他所要付出的代价竟然是他的色欲之魂。 大仓美菜（石原夏织 配音）是良介青梅竹马的玩伴，美菜内心里一直喜欢着善良的良介，然而却选择将这份感情深深的埋藏在心底。丽萨菈的妹妹裘儿（西口杏里沙 配音）亦身处人间界，一心想要打败姐姐取而代之的她却最终成为了失败者因此丧失了魔力，于是，裘儿和美菜签订了契约，就此，一段复杂的四人关系拉开了序幕。
泰迪•华斯比是一只出生在维罗尼亚的小熊，他善良可爱，聪明能干，富于冒险精神。他找到一张藏宝图，于是便和最好的朋友，八只脚的戈鲁比起程前往神秘莫测的未知国度格兰多。格兰多风景美丽，奇观繁多，这里还生活着许多人们前所未见的奇怪生物。华斯比他们很快结实了聪明的发明家牛顿•杰米克。在牛顿各种有趣发明的帮助下，格兰多每一个角落都留下了他们的欢声笑语。 当然，善良的另一面，邪恶如影随形。诡计多端，自视甚高的绿妖怪特维格经常不请自来，给华斯比他们的冒险增添了无数的刺激和乐趣。
据说，在这间边境公会中，有个只靠讨伐哥布林就升上银等（第三位阶）的稀有存在……一名女神官成为冒险者后，首次组成队伍出征，就在冒险中陷入了危机。而拯救了她的，正是那名被称为“哥布林杀手”的男人。 剑之圣女向哥布林杀手提出了委托，拜托他寻找动身前往歼灭哥布林后就一直下落不明 的千金剑士，于是哥布林杀手一行人来到了北方的雪山。不管是遭到袭击的贫穷村落或神秘的礼拜堂，以及这一次哥布林们的行动，这一切在哥布林杀手眼里都显得有些不太对劲。
