宇宙某处的行星“H12” 这颗与地球极其相似的星球，某日遭到了来自外星的宇宙怪兽袭击 在星球崩毁、走向灭亡之际，一名外星人独自逃往了地球 他的名字是“提欧”——一个孤单的外星灵魂，终将蜕变成“奥特曼” 他化身为明心大学兽医学部兽医学科三年级的学生“光石息吹”。尽管他仍难以适应地球人的常识，但却能与心爱的动物们心灵相通，过着平静的大学校园生活 然而，曾经摧毁他家乡的宇宙怪兽突然现身，地球危机迫在眉睫 当“想要守护”的强烈念头，振奋了那颗畏惧过去记忆的心时，耀眼的光芒将息吹的身姿变成了——蓝色的光之巨人！
桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。
