在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
为求仙药线索，一行人抵达统治岛屿的怪物"天仙"之居城。 欲从岛屿生还，死囚与处刑人已不得不携手合作。 与此同时，幕府以"山田浅卫门殊现"为首，下令增派人员登陆神仙乡。 其中竟可见与画眉丸素有渊源的石隐众之身影。 正当画眉丸等人欲尽快寻得仙药逃离孤岛之际，天仙们却拦住了他们的去路—— 围绕仙药的争夺，即将迎来"人类"与"天仙"的全面对决——！！
作为侯爵家的四子诞生的少年范恩自幼便被称为神童，备受期待。8岁时，他获得了被认为是毫无用处的「生产系魔术」。因此，他被父亲认为不配作为贵族，并遭到家族流放。因此，范恩被父亲认为不适合作为贵族，并被贴上失格的标签，随后被逐出家门。之后，范恩成为了一个无名边境村的领主，然而这个看似没用的生产系魔术，其实只要有材料就能生产任何东西，潜力惊人。在范恩的带领下，原本贫瘠的小村庄逐渐吸引各方人士，最终发展成为一座巨大的都市。
19世纪巴黎×吸血鬼×蒸汽朋克 ——您不曾听说过吗？ 关于将诅咒散播于吸血鬼的那本、机械驱动的魔导书的故事。 现在被“瓦尼塔斯之书”所引导、演员们集结于巴黎。 「潘朵拉之心」的望月淳所带来的吸血鬼谭——开幕。
身在魔王军却不会使用魔法的暗黑士兵达利艾尔， 以自己的才智和行动力爬上了四天王辅佐之位大显身手。 然而在四天王刚一换代，达利艾尔就被解雇了。 大失所望的达利艾尔彷徨在森林中，无意间遇到了一名被怪物袭击的少女！ 拯救了少女的达利艾尔在少女的“盛情招待”下来到了人类的村子。 本想在暴露自己是魔族之前溜之大吉的达利艾尔 却在少女的“请求”下留下来开始了冒险者之路。 「不是我不想拒绝，是她实在太大了」
