三年之约后，萧炎终于在迦南学院见到了薰儿，此后他广交挚友并成立磐门；为继续提升实力以三上云岚宗为父复仇，他以身犯险深入天焚炼气塔吞噬陨落心炎……
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
“流星塾”出身的“园田真理”，收到了来自父亲“花形”寄来的不明物品：“Faiz Gear和其专属机车”。为了问明父亲的用意，真理前往位于东京的巨大企业“SmartBrain”拜访父亲。途中遇上到处旅行的“干巧”，因真理放Faiz Gear的旅行袋和干巧被偷走的旅行袋一样而产生误会。正在争执的时候，两人被突然出现的不明怪物袭击．．．。 “把Faiz腰带交出来！” 另一边，“木场勇治”是一位家境富裕，父母慈祥和蔼，有交往将满一年女友的幸福青年。一场车祸夺走勇治双亲的性命也令勇治陷入昏睡。两年后，在勇治心跳停止，医生宣告死亡的当晚，“木场勇治”再次醒了过来．．．。
西川叶子（和久井优 配音）曾是衔着金汤匙出生的千金大小姐，过得是锦衣玉食的富足生活。然而某一日，父亲的公司破产倒闭，叶子不得不开始学习如何去过庶民过的那种生活。不过最近，她已经渐渐开始习惯她的庶民生活了，甚至从中找到了乐趣。 小田切双叶（金泽舞 配音）个性活泼开朗，有着超级旺盛的食欲的她曾经在数家店面里创下过大胃王挑战的记录，双叶不仅仅爱吃，在烹饪上也是一把好手。叶山照（今村彩夏 配音）表面看似成绩优异的乖乖女，实际上却有着非常腹黑的一面，每一天都在扮演着好学生的角色。这三个名字里都有“叶”的女孩成为了朋友。
