主角有马拓也为一个无所事事的高中生，他父亲是历史学家，却在研究时失踪，留下他与继母两人相依为命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹，里面有一个罗盘和三颗水晶珠，以及一封写着「时间是可逆的，历史是不可逆的」云云以及一些关于平行世界概念的信，并交待主角晚上去当地有名的地标剑之岬去见一个人。 拓也晚上如约来到剑之岬，发现自己的继母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收到的邮包交出来，并拔出枪来威胁他，千钧一发之际，一道闪电落下劈在了神社的御神石上，拓也就此晕去。等拓也甦醒过来周围已经旁无一人，回家睡了一觉后才发现不对劲。继母和龙藏寺完全不记得昨晚发生的事情，此时他才发现原来父亲寄给他的遗物是可以让人在平行世界自由穿梭的神奇道具，于是他为了找到父亲真正的下落展开了一系列调查。
故事发生在椚丘中学三年E班，表面上，这是一个普通的班级，然而实际上，这里聚集着的均是技艺高超冷酷无情的杀手。每一年，他们通过特殊渠道接收着来自世界各地的暗杀任务，替各国首脑“排忧解难”，而这一次，他们有了一个统一的目标——刺杀班主任杀老师（福山润 配音）。 杀老师是一个神奇的存在，它的外表并非人类，却有着及其敏感的神经和及其迅速的反应力，没有人知道它从哪里来，也没有人知道，它为何会变成三年E班的班主任。因为想要毁灭地球，杀老师成为了暗杀名单上的高价悬赏人物，而作为三年E班的学生，只要成功消灭杀老师，即可毕业。就这样，围绕着这位神秘的老师，充满了危险的日常就此展开。
梅普露沉迷于VRMMO『NewWorld Online』。防御力拉满，刚开始玩的时候想成为耐力型游戏玩家。她取得了多个凶恶的技能，并经历了一次又一次的蹂躏！因为异常的战斗状态，被人们视为“幕后黑手”级别的有名玩家。 和好朋友莎莉一起创建的公会【枫树】也吸引了很多个性独特的可靠的同伴，他们的联系进一步加强。然后—游戏里添了新的楼层，和曾经的对手联手，增加新的伙伴，还有新的活动开办！？ 在这里果然也会看到梅普露他们的大显身手……？ 世界很宽广，冒险将越来越有趣！
E级冒险者路德。他唯一的技能“异常状态无效化”，在充满瘴气的迷宫中采集药草时，除了采集外几乎毫无用处的鸡肋存在。战斗能力近乎为零，被冒险者同伴们戏称为“瘴气渔夫”。甚至被人讥讽为“饭桶”。为了打破这种现状，路德决定挑战新的迷宫，却遭到同伴背叛而遇险。物资耗尽濒临死亡之际，他毅然决定吞食被视为禁忌的魔物血肉——然而路德不断吞噬魔物获取新技能的“魔物吞噬者”冒险传奇，就此展开！
本片改编自TYPE-MOON出品的文字冒险类游戏《Fate/stay night》，是该游戏的Heaven's Feel路线，简称“HF”或“樱线”，是该系列作品动画剧场版全三部作品中的最终章。 在剧场版作品第二章黑化之后的樱吸收了众多Servant的灵魂后，被世间 所有的恶控制，成为黑色圣杯的化身。 最终，得知一切的士郎放弃了成为正义的伙伴，选择了保护樱...
