《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
贪婪的人类发现开普勒星后，疯狂开采该星的能源生物——卡拉萝，使得开普勒星寸草不生。菠菜为了找寻最后一株卡拉萝，与小伙伴奶泡泡、嘎嘎意外卷入了一场惊天大阴谋，为了拯救星球，三个小英雄不畏艰难，最终凭借勇敢和智慧战胜了比自己更强大的敌人。
