突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。 不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾，14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切，一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。
以传奇杀手坂本太郎为主角，金盆洗手的他与亲爱的家人平静度日，没想到有刺客接连来袭，幸福家庭生活恐将好景不常。这下子坂本太郎必须与伙伴联手，守护他的幸福日常。
虽然贵为公主，但艾丽莎（劳拉·贝莉 Laura Bailey 配音）的个性实在是太过于活泼了，常常在宫里惹出各种各样的麻烦需要爸爸妈妈帮她善后。为了学习宫中的礼仪，艾丽莎被送到了女王处，严格又古板的女王令艾丽莎头痛不已，她一点都不想变成一个真正的翩翩优雅的公主，她真正想要当的其实是一名海盗！ 在罗杰斯勋爵的帮助下，艾丽莎拥有了属于她自己的船，一行人开始了他们在大海上的旅程，途中，众人来到了一座神秘的小岛上，在那里，艾丽莎结识了卢卡斯（尤里·洛文塔尔 Yuri Lowenthal 饰）。岛上生活着许多凶猛的野兽，艾丽莎决定帮助卢卡斯逃离这里。
伍六七接到神秘任务过程中却意外丧失记忆，为了唤醒记忆，伍六七去到过往记忆发生的地方见到记忆相关的人，其身世之谜也随之逐渐浮出水面。
