本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。在跨越无数的试练后，武藤游戏与身体内的另一人格“暗游戏”进行最终决战并获胜，在作出正式诀别后踏上各自的旅途。在经历一段时间后，游戏等人重新回归平凡的生活。然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
更衣小夜是私立三荆学园的高中二年级学生，虽然平常和同学们一起过着普通的学园生活。但是另一方面，她还要接受父亲的命令完成某项“任务”。那就是狩猎被称为“古物”，拥有远超过人类力量，并且以人类为食的东西。小夜作为唯一可以打到“古物”的人，为了守护他人、为了自己最喜欢的父亲，使用浮岛神社传承下来的御神刀独自战斗着。
普通大学生林海，意外升级微信，却加入了天庭神仙们的聊天群，从此，三界倒卖，开店唠嗑，生活变得多姿多彩。
秦羽飞升进入仙魔妖界，因机缘遇见了柳寒舒，在他身上看到了之前的自己，决定收他为徒教他保护自己的方法，但因为宝物星图与柳家和玉剑宗结下梁子，最终以柳寒舒的死亡拉开序幕，秦羽走上与强大对手的对抗之路，努力刻苦修炼，让自己变得更加强大，坚持自己中心的正义之道，也想守护自己在乎的人。三兄弟飞升别离，为寻好兄弟，秦羽踏上了漫漫长路，究竟小黑与侯费在何处，他们能否再次重逢。
仁岁千岁是一个普通的中学生，从小父母双亡，在孤儿院长大的他住在父母留给他的独栋房子里，过这着孤独而平静的生活。可是由于五位美丽女老师入住，使他生活从此不再有往日的平静。
五位女老师的*格各异，还有很多奇怪的嗜好，冲突当然是不可能避免了，家里被五位老师搅得不得安宁。为了争当千岁的妈妈的位置，五位老师想尽了各种办法……
终于，千岁终于受不了这无休止的“家庭游戏”，赶走了五位老师。他的生活又恢复了往日的平静。可是没有老师们“胡闹”的日子里，千岁总觉得仿佛缺少了些什么，后来，千岁发觉自己真的很害怕失去她们，最后，他对五位女老师说到：“我不想自己带着五把同样的钥匙……以后…请多多照顾了……”
