东京都高度育成高等学校，以升学率和就业率100%而自豪， 每个月都有相当于10万日元的积分的梦幻般的学校。 但实际上，这是一所实力至上主义的学校，只有一部分成绩优秀的学生才能受到优厚的待遇。 绫小路等人在1年级第3学期升格到C班， 第一学年最终特别考试的结果，惜败A班，再次降级到D班。 2年级从D班重新开始。 春假过后，绫小路与轻井泽成为恋人关系。 堀北与憧憬优秀哥哥·学的自己诀别。 在人际关系逐渐变化的过程中，大家升入2年级。 绫小路等新2年级生最初的特别考试， 与新生搭档进行笔试。 但是，新生中混入了月城所安排的来自白色房间的刺客——。 跨越学年的新关系带来的是暴风雨还是风平浪静？ 第2年的学校生活现在拉开了帷幕。
真壁政宗（花江夏树 配音）小时候是个小胖子，被同班同学取了“猪脚”的绰号，整日生活在自卑和嘲笑之中，之后，政宗转校，同时接受了为期八年的训练，终于恢复了正常人的身材，亦意外的发现自己其实拥有一副帅气的面孔。如今，政宗回到了曾经生活过的城市，满腔怒火的他制定了一系列报复计 划，发誓要让当年给他取绰号的女孩安达垣爱姬（大桥彩香 配音）体会一下他曾经体会过的屈辱。 和政宗有着相似经历的千金大小姐藤之宫宁子（三森铃子 配音）、沉默寡言内向腹黑的小岩井吉乃（水濑祈 配音）、沉迷于耽美文化的腐女子双叶妙（田所梓 配音），在这些可爱女孩子们的围绕下，政宗的复仇计划能够顺利实施吗？
在某个时间点的日本，突然出现了文学书全部被染黑的怪异现象。 这是由书中带着负面情绪诞生的“侵蚀者”所导致的灾难。 被侵蚀的文学书，会逐渐地从人们记忆中消失，最后变得像是从一开始便不曾存在过一样。 于是，有特殊能力的“炼金术师”作为特务司书被派遣至图书馆， 为了对抗破坏书 中世界的“侵蚀者”、为了守护文学，与转世的文豪们一起战斗。
物語は新たなステージへ── 『POP IN ２』のリリースから半年。 ＭＥＭちょの尽力の甲斐もあり、今やB小町はブレイク寸前。 アクアはマルチタレント、あかねは実力派女優の道を順調に歩んでいる。 一方で、かなは以前の明るさを失っていた。 そして、アイとゴローの死の真相を追い求め、ルビーは芸能界を駆け上がる。 ────嘘を、武器にして。
故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle meiju5.net)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云宝黛西（RainbowDash）与碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小马都代表着友谊的每个元素，并在和谐水晶（E... 故事叙述一只叫暮光闪闪(TwilightSparkle)的小马为了执行导师塞拉斯提娅公主（PrincessCelestia）给她的任务，与助手斯穗龙（Spike）一起来到小马镇学习有关友谊的魔法的知识，其中她认识了苹果杰克（Applejack）、瑞瑞（Rarity）、小蝶（Fluttershy）、云宝黛西（RainbowDash）与碧琪（PinkiePie）五位好朋友，每只小马都代表着友谊的每个元素，并在和谐水晶（ElementsofHarmony）中，各扮演重要的关键元素。此后，暮光闪闪(TwilightSparkle)便与她认识的新朋友们开始了有趣的日常生活，在第四季时暮光闪闪（TwilightSparkle）和她的五个朋友在第四集以及之后开始写日记。
随着武魂融合技的锋芒消散，切磋赛最终以唐舞麟所带领的一年级组获胜而告一段落。片刻宁静后，一年级生们的期末考试也如期而至。学院提出的种种难题令众人捉襟见肘，唐舞麟等人也不例外。他们使出了各自的看家本领，为通过考试，跌跌撞撞的踏上了明都之行……
