边见瑞纪（下田麻美 配音）的爷爷拥有一家古书店并且将它出租给了学者砚周（土田大 配音）。一日，瑞记偶然打开了一本名叫《蜘蛛怪异闻》的古书，没想到，一只娇小可爱的蜘蛛娘（金田朋子 配音）从中掉了出来。蜘蛛娘告诉瑞纪自己曾被一个阴阳师所救抚养长大，后又被封印在书中，而砚周就是那位阴阳师的转世。砚周很同情蜘蛛娘的遭遇，收留了她。但一名古籍师告诉砚周，蜘蛛娘是非常危险的生物，只要接近她就会在不知不觉中被迷惑从而丧生。 不听劝告的砚周决定将蜘蛛娘送回到她的母亲所在的地方，那是一幢阴森的古宅，里面有一只巨大的蜘蛛正匍匐在黑暗中等待着它的猎物。
在火焰魔女事件之后，莫凡再次投入到魔都学府的修炼中，但就在最关键的时刻，突然传来了好兄弟张小候失踪的消息。重感情的莫凡立即停止赛程，带着魔都血族好友柳茹共同赶赴古都，闯入了正处于妖魔活跃期的中心地带。
升入同一所高中的浅葱优希也和樱美玖，是一对“双向暗恋”的青梅竹马。 明明已经察觉到了自己的心意… 明明那句“喜欢”随时都要溢出来… …可是，就是无法坦诚相待！！ 太过亲近，又太过遥远的优希也与美玖。 维系着两人的，是小学六年级时开始的“我爱你游戏”。 轮流说出“我爱你”，谁先害羞谁就输。 直到现在仍在继续的，这场较劲。 想要赢得“我爱你游戏”后，再告白──。 想要赢得“我爱你游戏”，让对方承认自己的“喜欢”──。 为了结束这场双向暗恋， 倾注所有心意的“恋爱游戏”，现在开始！！
与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
