电视动画《众神的恶作剧》改编自2013年10月24日发售的同名PSP乙女向恋爱冒险游戏。本作的舞台设立在了各种各样神话中的众神聚集的世界，主要讲述了各神话中的代表神明聚集到这个世界，商量着如何打破众神中存在“讨厌人类的问题儿”这一现状。神明是爱护人类、被人类崇拜的存在，而神明与人类的关系变得稀薄是一件令大家担忧的事。于是为解决这个问题，这个世界里建起了与人类就读的学校十分相似的“校舍”，并选出一名人类少女——草薙结衣来教会这些问题神明何为“人类”、何为“爱”。就这样结衣与神之间的禁断之恋正式开始。
主角大狼十三自小被组织捡养，并成为传说级杀手。某次任务中，他遭到神秘生物兵器刺中，竟意外变回中学生的模样，从此开始了国中生活……
公元2307年，地球的化石燃料枯竭了。经过将近半个世纪的建设后，建成了全长5万千米、以3条轨道升降机为中心的太阳能发电系统。为了建造出这个能制造半永久能量的巨大建筑物，世界形成了3个巨大的国家联盟：以美国为中心的“世界经济联盟”，通称UNION；以中国、俄罗斯、印度为中心的“人类革新联盟”；新欧洲共同体AEU。由于轨道升降机过于巨大，防卫变成了十分困难的任务。但各国军队依然为了自己的威信与繁荣进行着大规模的zero-sum game（任何一方都得不到好处的竞争）。这样的世界，要为其花上句号的组织出现了——拥有机动战士高达的“天人”私人武装组织。他们为了消除世界的纷争，展开了超越民族、国家、宗教的作战行动。高达驾驶员刹那•F•清英决心改变这个世界。
