故事依旧围绕斗龙战士的冒险、友爱、热血的战斗精神展开叙述，通过宝贝龙拍档和原始恐龙之间的经历和磨炼，以及斗龙战士之间的情感变化，多角度的弘扬斗龙精神，让孩子们体会成长中遇到的挫折和变化，让人类向原始恐龙学习来自原始恐龙世界的美德，共同为创建人类更美好的未来而努力。
作为民间警备组织E.G.I.S.的一员工作的工藤优信，有着变身为泰迦，泰塔斯，风马这个3人的奥特曼的能力。经过与无数敌人的战斗，优信和泰迦之间的羁绊更加深厚。但是，他们现在却被什么人瞄准了。知道这件事后，新生代的奥特曼们为了拯救他们，陆续集结。小光、翔、大地、凯、小陆、勇海、活海都来了。并且，泰迦的父亲，泰罗也来到了地球。但是，泰罗却猛烈地袭击了儿子泰迦。泰罗到底怎么了？泰迦能和父亲战斗吗！？现在，新生代正面临着巨大的黑暗力量！
