高中三年级的筒井光是所谓的御宅族少年。 只要有游戏或动画里的二次元女生的话，感觉就能独自一人生活了……。 但，他突然被超绝3D（现实）美少女·五十岚色叶告白，并开始和她交往！ 在被奔放的色叶玩弄于股掌之间的同时，筒井逐渐爱上了她……。
ゾイドとは、銀河の彼方に生息する、戦う意思を持った金属生命体である。 惑星が最後を迎え、人類は第二の故郷として地球を目指すが、ゾイド因子の暴走と不慮のタイムワープで、突如、21世紀の地球にゾイドが出現。ゾイドによる破壊と度重なる地殻変動で地球は一度滅びた。 レオは自ら発掘したビーストライガーを相棒に、地球の未来を左右する少女サリーと冒険の旅に出発した。
