白小纯合并下游四宗成立逆河宗后，成功挑战中游三宗立稳脚跟，被上游星空道极宗天人指名做质子，开启第三季质子篇。
哆啦A梦与大雄驾驶具有时光跳跃机能的“时光齐柏林飞船”，为了寻找自古以来许多冒险家梦寐以求的亚特兰提斯和龙宫城等每个人都曾想像过的梦幻乌托邦，在空中展开了一场大冒险。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
向水日菜子（川荣李奈 配音）是一位冲浪爱好者，对大海有着强烈的热情和真挚的喜爱，只有在风口浪尖处，她才能够感受到自己真正的在活着，可是别看日菜子在海上神气活现，在生活里，她其实是一个多思多虑的女孩，对未来感到深深的迷惘。 一场活在让日菜子结识了名为雏罂粟港（片寄凉太 配音）的消防员，勇敢正直的港很快就吸引了日菜子的注意，两人一拍即合走到了一起，开始了一段充满了幸福的恋情。可是好景不长，一场海难夺走了港的生命，日菜子无法接受竟然是自己挚爱的大海夺走了她最爱的人。某日，陷入消沉许久的日菜子哼起了两人在一起时经常会唱的那首歌，令她没有想到的是，港竟然出现在了自己的面前。
结城梨斗（渡边明乃 配音）是一位平凡的高中生，暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里 配音），然而，腼腆的梨斗决心将这份真挚地感情深深埋藏在心底，每日只是在角落里偷偷地凝望着自己的女神。 某日，一位名叫菈菈·萨塔琳·戴比路克（户松遥 配音）的外星女王突然从天而降，成为了梨斗的同居人，就这样，梨斗开始了和菈菈一起的没羞没臊地生活。金色暗影（福圆美里 配音）本是为了暗杀梨斗而来的宇宙第一杀手，却莫名其妙地留在了地球，为了让金色暗影重新返回杀手界，黑咲芽亚（井口裕香 配音）被派出来到了梨斗的身边，这一次，又会有怎样有趣的故事发生呢？
