该季讲述了，拥有“武神躯”的少年镇魂将一一曹焱兵为寻父母下落，与少女夏铃、北落师门等队友，闯入灵域禁地芦花古楼，并与守卫者“风花雪月”四王展开激烈交锋的冒险故事。
今年，大学新鲜人泽木惣右卫门直保（坂口大助 配音）进入农业大学农学部，开始了全新的大学生活。其貌不扬的直保有一个天大的秘密，他能够看见存在于空气中的“菌”，甚至能够徒手抓住菌以及与其对话，这样的超能力对于农业专业的直保来说，无疑是如虎添翼，但是，麻烦也随之而来。 作为直保的亲梅竹马，直保的秘密无疑为家中经营酿酒行业的结城萤（斋贺观月 配音）创造了不少的便利。同时，外表意外老成的学长美里熏（小西克幸）和各方面都圆滚滚的川滨拓马（杉山纪彰 配音）都对直保产生了浓厚的兴趣。在崭新的校园里，直保和各式各样的菌在一起的生活就这样开始了。
阴阳师首部同人漫画《百鬼幼儿园》动画化制作决定！ ↓↓↓ 《百鬼幼儿园》由FACEBOOK超人气画师-Mïïn敏的同人漫画改编，以Q萌画风描绘百鬼幼儿园里发生的种种趣事o(〃'▽'〃)o~ 动画化之后的幼年崽崽们，想必又要萌倒一片阿爸阿妈了！
有一个外号邋遢大王的小男孩，他特别邋遢，不讲卫生，信奉“不干不净，吃了没病”。这天，鼠王想征服人类、称霸世界，于是想找个人来当他的细菌武器的试验品。鼠国密探看中了邋遢大王，因为只有他会吃不干净的东西，于是，邋遢大王喝了被老鼠下了药的橘子水后，身子变成了和老鼠一样大小，被老鼠密探骗到了老鼠王国！来到老鼠王国后，邋遢大王真正感到后悔了，想回家却又无奈被关了起来。幸好邋遢大王认识的好友小猫小狗把鼠博士准备在他身上做实验的换掉了，邋遢大王才逃过一劫。邋遢大王最终能否逃出鼠国？
天降神物！异血附体！群仙惊惧！万魔退避！一名从东洲大陆走出的少年。一具生死相依的红粉骷髅。一个立志成为至强者的故事。一段叱咤星河，大闹三界的传说。
