高度发展的都市，拉塞尔市。 在讴歌繁荣的这座城市中，动摇这个世界的巨大阴谋开始启动—— 立刻察知阴谋动向的男人索德，为了揭露阴谋而投身于不为人知的战斗当中。但他得到的线索却只有“El Dorado”这样的关键字而已。在战斗当中，索德遇到了一位名叫索菲亚的少女。索菲亚也在寻求着失踪的哥哥皇后留下的讯息“El Dorado”的含义。索菲亚失去了皇后，而索德也有过失去妹妹的过去。被“El Dorado”这一字句所吸引的两人，从对方身上感受到看不见的羁绊，并开始一同行动。 就这样，各自的心意交错的旅程开始了——
宇宙某处的行星“H12” 这颗与地球极其相似的星球，某日遭到了来自外星的宇宙怪兽袭击 在星球崩毁、走向灭亡之际，一名外星人独自逃往了地球 他的名字是“提欧”——一个孤单的外星灵魂，终将蜕变成“奥特曼” 他化身为明心大学兽医学部兽医学科三年级的学生“光石息吹”。尽管他仍难以适应地球人的常识，但却能与心爱的动物们心灵相通，过着平静的大学校园生活 然而，曾经摧毁他家乡的宇宙怪兽突然现身，地球危机迫在眉睫 当“想要守护”的强烈念头，振奋了那颗畏惧过去记忆的心时，耀眼的光芒将息吹的身姿变成了——蓝色的光之巨人！
