哆啦A梦与大雄驾驶具有时光跳跃机能的“时光齐柏林飞船”，为了寻找自古以来许多冒险家梦寐以求的亚特兰提斯和龙宫城等每个人都曾想像过的梦幻乌托邦，在空中展开了一场大冒险。
同时拥有显赫出身和悲痛过去的卡路尔·阿巴斯（花江夏树 配音），以庶民的身份和无血缘的妹妹艾丽尔（竹达彩奈 配音）登上伊斯拉，前往凯格斯高中飞行科学习。伊斯拉是一座漂浮在半空中的陆地，由巴雷特洛斯共和国等三个国家共同管理。在动力的驱动下，伊斯拉开启了遥远的征程，前往传说中的圣泉寻找“天空的尽头”。然而仅有极少数领导层成员知道，伊斯拉此行还有另一个不可告人的使命。卡路尔偶然邂逅了贵族女孩克莉亚·库鲁斯（悠木碧 配音），他们彼此互生好感，并结成飞行训练搭档，但卡路尔却不知晓他和这个女孩有着怎样痛苦的孽缘。满怀理想的少男少女遨游长空，等待他们的是何等严酷的命运…… 本片根据犬村小六（小说）、森泽晴行（插画）创作的轻小说改编。
概要 只要是有美味佳肴的地方，就一定会出现一位自称美少女天才魔导士的莉娜，和一位自称是其保护者的高里。一如往常地来到以盛产章鱼闻名的海边城市，想说只需帮忙捕鱼便可免费享用章鱼美食；却因莉娜太过於热衷捕鱼，造成不只鱼群所在处，甚至连船只都遭受破坏，最後能享受到章鱼美食的只有高里……。不过这却是整个恐怖事件的起源！一食用章鱼的人就会得到所谓「只会说章鱼话」的怪病，因而高里也被传染了。但是事件演变到没吃章鱼的人也被传染怪病，灾害持续扩大；听说高里深陷危机而前来帮忙的杰路刚帝士和阿梅莉亚也被传染，甚至连唯一的救星莉娜也无法幸免……。被封印住的魔族即将复活，人类灭亡的末日可说即将来临！莉娜她们能拯救这个世界吗？还是可以吃到美味的章鱼呢？ 本作以TV系列的角色（高里、杰路刚帝士、阿梅莉亚和杰洛士）为主。莉娜的服装也是以TV系列为基准。另一方面，开头的BGM是继承自剧场版系列。
