表面上看来，索尼娅（田村睦心 配音）是一个扎着双马尾的金发美少女高中生，但实际上，她有着一个秘密的身份——杀手。作为一名杀手，索尼娅有着异常敏锐的神经，任何突然靠近她的生物，都会受到她的强力攻击。少女折部安奈（赤崎千夏 配音）自称是索尼娅的朋友，但似乎没有得到索尼娅的认可。因为其大大咧咧的天然呆个性，安奈经常成为索尼娅本能攻击的受害者。 在无意间，安奈发现，虽然索尼娅是个令人闻风丧胆的杀手，但她在昆虫和妖怪方面却有着意外小的胆量，这也成为了拉近二人关系的重要契机。同时，索尼娅的杀手同事吴织亚切（高部爱 配音），毫无存在感的不知名少女（钉宫理惠 配音）也来到了安奈的身边，杀手和少女们热闹的日常生活展开了。
曾几何时，一个神秘奇怪的生物（关智一 配音）将月球的70%蒸发掉，并且扬言在次年的3月破坏地球。为了捍卫地球，各国政府出动军队，调派最先进的武器攻击这个可怕的怪物，可是他们用尽了各种办法，却没有起到任何效果。谁知就在恐慌逼近的时候，该生物竟然来到椚丘中学3年E班担任老师，以潮田渚（东山奈央 配音）、赤羽业（冈本信彦 配音）为首的学生们各显其能，试图干掉这个“杀老师”，无奈对方拥有20马赫的速度，杀他几乎成为一件不可能的任务。平静的日子缓缓流淌，学生们丝毫没有放弃暗杀老师的念头。这一天，京都的修学旅行即将举行，少男少女各自组队，准备迎接快乐的时刻，同时策划对“杀老师”进行新一轮的暗杀…… 本片根据松井优征的漫画改编。
因为极度腹痛而倒下的金田一，被送到了不动山市内有名的圣正综合医院。然而偶然的，金田一在医院的厕所里发现了尸体。尸体的脖子上有着明显的注射痕迹，地板上又别有用意的放置了一个“铃”。这个铃，据说是和三年前发生在医院内的惨剧有关的“死神之铃”。 突然被卷入杀人事件的金田一、不断发生的事件、逐渐明朗化的目标、当事人的“再一张脸”……犯下冷酷罪行的杀人者的动机到底是什么？遗留的“死神之铃”究竟有着什么意义？踏入栖息着不祥死神的医院的金田一，能够揭开事件说出真相吗？ 此为SP1
