曾经的一场人魔大战令两方人马都元气大伤，如今，战争的硝烟已然散去，却遗留下了诸多的难题要一一破解。人类为了赢得战争而锻造了大批拥有强大力量的武器，人们称之为“神诲魔械”，战争结束后，这批破坏力强大的武器的去向则成为了需要解决的首要问题，大家都同意将它们交由护印师来保管。 丹衡（平川大辅 配音）和丹翡（中原麻衣 配音）兄妹两，身为护印师，担负起了保管最强兵器“天刑剑”的职责，却也给两人引来了杀身之祸。最终，天刑剑还是落入了蔑天骸（关智一 配音）的手中。为了追回魔剑，丹翡踏上了旅途，期间结识了凛雪鸦（鸟海浩辅 配音）和殇不患（诹访部顺一 配音）两人。
时空之隙开启，书院众人来到了现代课堂，新课堂新老师新朋友，可爱的小伙伴们又会产生什么样有趣的故事呢？航天知识的小剧场即将开讲啦！敲黑板！记得认真听课，科学小记者们还有很多小知识要传授给大家哦！！
尹深是超人气阳光少年组合FLY的舞蹈担当，因其不按套路出牌的性格，常常在招黑同时却又能不经意触到大众的High点和笑点。相比较每每招黑过后，山一般碾压的舆论，以及常常对FLY团造成负面影响的尹深，FLY团容貌秀美的主唱和创作担当梵允诺和FLY团沉稳冷静的团长和全能担当流莲在团里显得异常“普通”而又可靠。但如日中天的FLY团也有自己的忧愁，像是成团许久没有自己的代表作，允诺一直想出自己的个人专辑，流莲拼命努力想要在演艺圈占有自己的一席之地等等。就在所有团员都有着自己发展打算的时候，势不可挡的BH团与新晋团体4s团开始活跃在大众视野中，眼看FLY团的顶级地位即将被威胁，三人会如何化解眼下的人气危机呢？
