现在,全世界所有人都在使用的智能手机App。 那里潜藏着无人知晓的存在·Applimonster,通称“Appmon”。 Appmon是具备能够自主思考行动的人工智能的App生命体, 在人类世界与数码空间的间隙中,为系统及人类发挥着机能。 但,潜藏在网络之海中的“凶恶的最终BOSS人工智能·利维坦” 化作病毒控制了Appmon们,并开始黑入各个系统, 企图从网络一侧控制人类的世界。 主人公少年·新海春, 获得了被伟大的意志引导的“App驱动”, 并使来自“App芯片”的搜索App·GATCHIMON实体化了。 隐藏在“App驱动”中的谜团, 处在Appmon所潜藏的网络世界与现实世界之间的不可思议的“场”, 以及2只Appmon进化的“App合体”到底是什么?“利维坦”真正的目标究竟是……!? 爱好读书的少年春,与搜索App的怪兽·GATCHIMON这一对凸凹组合, 奔驰于现代世界的新感觉搭档物语, 现在启动!
随着友哈巴赫攻入灵王宫,死神与灭却师展开了最终决战。灵王陨落,现实世界随之崩塌。昔日的宿敌联手突入已发生异变的宫殿,共同迎战威胁万物存续的危机。