《黑子的篮球》故事主要围绕两位主人公——被誉为第六位“奇迹世代”的黑子哲也以及从美国归来的天才篮球选手火神大我展开，两人在球场上市光与影的搭档。相遇后的他们将挑战其他五位“奇迹世代”。
男主角卜部征人被自己的爸爸捧为新兴宗教「神地崇教」的接班人，在献祭仪式中意外转生到异世界。征人原以为终于不会有人因为被笑信奉邪教而疏远他，但这个国家饱受皇家爆政所苦，不忍好友被无故赐死的征人默默祈祷，拥有超强神力的「御灵」马上前来搭救他，而这个御灵竟然就是神地崇教的真神 「御灵」……
片濑高中的新生“阿扁”星野裕（片山福十郎 配音）和“笑爷”月本诚（内山昂辉 配音）是同出自一个乒乓球道场的朋友。阿扁个性张扬，爱说爱笑，由于对球技信心十足，因此根本不把乒乓球部的同期和前辈放在眼里。与之相对，笑爷内敛冷静，对于取胜这件事似乎根本没有半点强烈的欲望，潜意识中他更希望像机器人一般不被人注意到。为了迎接即将到来的高中联赛，乒乓球部顾问小泉老师（屋良有作 配音）选定月本进行操练。与此同时，附近的辻堂学院高中转来了被踢出国家队的中国选手孔文革（文晔星 饰），此人恃才傲物，完全不把技术底下的日本选手放在眼里。另一方面，高手云集的海王学院高中也蓄势待发，备战接下来的大赛。方寸球桌，战况激烈…… 本片根据松本大洋的同名原作改编。
