人類と怪獣との長い戦いは終結し、平和が訪れた。そんな時代に、怪獣の魂を宿し、怪獣の姿に変身できる少女“怪獣娘”たちが現れる。彼女たちを集めて結成された特別組織“ＧＩＲＬＳ”に、新人としてアギラ、ミクラス、ウインダムの3人が配備されることに。立派な怪獣娘になるべく訓練を受けるデコボコトリオの明日はどっちだ……!? ショートアニメ『怪獣娘（かいじゅうがーるず）』は、怪獣娘たちによる笑いあり涙ありバトルありのドタバタコメディ。
故事讲述一只豆狸化身为少女「小豆」来到大正时期的大城市大阪，却被一名黑发少女一眼识破了真面目。那名自称是「落语家」的美女毫不留情地告诉他「赶紧滚回乡下去！」…美人师父和豆狸少女的落语幻想物语，就此开幕！
故事将衔接TV版第三季结局紫悦(Twilight Sparkle)进化为天角兽(Alicorn)加冕成新公主之后的生活，此时水晶帝国的珍贵王冠被偷窃；为了寻回王冠，紫悦公主将接下重责大任，独自前往另一
