10 年前，世界与其他次元链接的“门”被打开，各种魔物不断出现，于是乎能力各异的猎魔者也随之出现，被称为“猎人”。程肖宇是一名实力最弱的 E 级猎人，在一次挑战任务中，遇到了可怕的隐藏挑战。生死存亡之际，他居然获得了升级系统！在系统的利用下，他能成为最强猎人吗？
宫藤芳佳于人类的防卫线“第501统合战斗航空团”入伍！……但是，重要的敌人·内洛伊迟迟不来。于是大家过着非战斗，而是忙于做饭洗衣的日常。有时被充满个性的队员们折腾，有时会吐槽，有时做后援，如此的芳佳和愉快的魔女们的奇怪日常就此开始！
本作是为了纪念在1996年起开始的《游戏王》系列漫画连载二十周年所推出的动画电影。在跨越无数的试练后，武藤游戏与身体内的另一人格“暗游戏”进行最终决战并获胜，在作出正式诀别后踏上各自的旅途。在经历一段时间后，游戏等人重新回归平凡的生活。然而，一名自称蓝神的神秘少年却出现在他们的眼前。另一方面，将暗游戏视为劲敌的海马濑人，在暗游戏消失的地方发掘“千年积木”并打算将其重新完成，试图再度复活暗游戏。
