BD&DVD各卷收录的特典动画短篇，共6话，收录TV版未播放的一些场景画面。 卷数BD&DVD发售日 12015年3月27日 22015年4月24日 32015年5月29日 42015年6月26日 52015年7月31日 62015年8月28日
你来做我的助手吧。” 有着被卷入事件体质的少年・君冢君彦，在高空一万米的飞机中成为了自称是侦探的天使般的美丽少女・希耶丝塔的助手。两个人为了同世界各地的敌人战斗，三年来在世界各地飞来飞去，展开了令人目眩的冒险旅程。——不久之后，侦探就去世了。 动荡的日子已经过去了一年。已成为高中三年级学生的君冢也沉溺在了名为日常的温水中，过着极其普通的学生生活。在这样的君冢身边出现了一个委托人。 “你是名侦探？” 以和同年级的少女夏凪渚相遇为契机，连接过去和现在的壮大故事再次开始了——
与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
女娲娘娘为了造福人间，创造出了能够帮助人类的神兽，哪知道邪恶而又贪婪的元始天魔利用了善良的神兽，将它们污染变为了残暴的魔兽，驱使它们祸害人间，企图就此成为统治世界的霸主。 问天（马小冀 配音）是南宫城城主的儿子，一次偶然之中，他得到了神兽天晶兽（王凯 配音），让问天没有想到的是，天晶兽竟然幻化成为了神兵，拥有着足以打败魔兽的强大力量。与此同时，问天的妹妹问雅（刘旭莹 配音）从母亲的血脉里遗传了净化之力，能够净化遭到黑暗力量侵蚀的神兽，在兄妹两人无间的配合之下，正义的势力逐渐的壮大起来。元始天魔眼看阴谋无法得逞，于是召唤出了更加强大的敌人玄天邪帝。
