宇宙某处的行星“H12” 这颗与地球极其相似的星球，某日遭到了来自外星的宇宙怪兽袭击 在星球崩毁、走向灭亡之际，一名外星人独自逃往了地球 他的名字是“提欧”——一个孤单的外星灵魂，终将蜕变成“奥特曼” 他化身为明心大学兽医学部兽医学科三年级的学生“光石息吹”。尽管他仍难以适应地球人的常识，但却能与心爱的动物们心灵相通，过着平静的大学校园生活 然而，曾经摧毁他家乡的宇宙怪兽突然现身，地球危机迫在眉睫 当“想要守护”的强烈念头，振奋了那颗畏惧过去记忆的心时，耀眼的光芒将息吹的身姿变成了——蓝色的光之巨人！
在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司！命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。 就是在这种情况下，在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。
通过这部动画，孩子们能够从中感受到快乐，拓展对世界各地文化的认识，并且学习到超级飞侠和小朋友们的团结友爱、热情善良、互帮互助、一起成长的美好品质。
