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距离“天人五衰”企图的消灭国家的计划还剩6天。
有着人类少女的样貌，却不同于人类的存在――精灵。她们拥有强大的能力，从邻界现身时，因为会伴随名为『空间震』的灾难，她们甚至被称为人类的天敌。面对精灵的威胁，人类能采取的手段，是以武力歼灭，或是――『与精灵约会，使其娇羞』！五河士道能通过让精灵娇羞并亲吻精灵来封印她们的灵力。靠着这个特异能力持续拯救人类及精灵们的士道身边，有股巨大波涛即将袭击而来。身为世界屈指可数的巨大企业且想获得精灵力量的DEM社，为了夺取士道的性命，将大举来袭。于是，士道记忆深处里的神秘少女现出原形――各种想法错综复杂，史上最大的战争即将开始。
海崎新太（小野贤章 配音）的人生在二十七岁之时走入了死胡同之中，工作仅三个月就选择辞职，两次参加考研却均无功而返，想要找一个可以糊口的工作却屡屡失败受挫，新太不知道也不想知道，究竟还会有什么在未来等待着他。 某日，新太失魂落魄的走在街头，偶然遇见了一位名叫夜明了（木村良平 配音）的神秘男子，并邀请他参加一个看起来极为不祥的实验。在巨大的利益诱惑和保证能够找到工作的承诺面前，满腹疑虑的新太产生了动摇。按照要求，新太将要服下一颗神秘的药丸，之后，他的外表将会回到十七岁的样子，新太需要进入高中三年级就读，整个实验为期一年。就这样，新太回到了校园之中，在这里，等待着他的会是怎样的生活呢？
公元二千多年时，地球陷入了空前的危机。无数的慧星从太阳系通过，而且在不久的将来将会墬落到地球，地球也将会可能会受到很大的伤害。为此，人类设立了行星危机管理机构，在卫星轨道上也设立了慧星迎击基地，同时也开始了去除对地球有威胁的行星。 在迎击部队中最令人注目的就是将驾驶配备有特殊ミサイル的宇宙迎击机参加下次慧星破坏行动的驾驶员的到达。他们也被叫做 コメットブラスター，他们这些人的存在也渐渐为人所知。 地球各地路续建起了好几个超高度迎击基地。在地球上有一个基地是专门给有配备特殊ミサイル迎击部队－メテオスイーパー所使用的，这个迎击部队主要就是要消灭在宇宙中没被粉碎的巨大碎片。在这个基地中同时也有一些训练设施给想成为コメットブラスター，进而取得在宇宙工作资格愿望的人。 虽然地球还是承受着小陨石的损害，但是因为他们的关系，地球好几次从灭亡的危机中存活了下来，而至今也还是存在着。 之后过了数十年－
