户外实践归来后，萤草老师暂时隐退养伤，而SSR班却迎来了新的难题--升星考试!面对这位“严格的”校长助理白藏主，同学们将面临全体留级的巨大危机!而另一边，酒吞和茨木却震惊的发现:一向相亲相爱的SSR班中，竟然还混入了神秘的身份--风纪委员。面对内外双重危机的SSR班同学们，即将迎来如同狂风骤雨般的新一轮挑战!
校园女神鹰峰和一点都不起眼的白田虽然从小同校，但从来没有什么交流可言。某日，白田在阴错阳差下目睹了鹰峰的更衣现场，更进一步发现她竟然拥有透过脱下内裤来穿越时空改变因果的超能力！而为了让自己能够随心所欲的使用这个能力，被鹰峰使诈陷害的白田逼不得已，只能选择成为她的衣柜！
平凡小镇，生活在五口之家的普通小学生高町奈叶（田村由香里 配音）与好友月村铃鹿（清水爱 配音）和爱丽莎·巴尼斯（钉宫理惠 配音）过着无忧无虑的生活。这一日，她们偶然发现一只类似水貂的动物尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰）。受伤的尤诺得到奈叶等人的救助，谁知接下来小镇便连续出现各种怪物。在尤诺的帮助下，奈叶利用Rising Heart变身成为魔法少女，击败了入侵的怪兽，并且得知关于能量结晶快Jewel Seed的秘密以及自己的使命。此后的日子里，她为了成为合格的魔法少女背着好友们展开修行。这一晚，神秘魔法少女菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）突然出现，与奈叶展开激战。 她们之间的夙缘由此展开……
来上海打工的无名之辈阿娟（李昕 配音），为了赚钱给父亲治病，同意代表没落的传武拳馆参加“上海格斗之夜”武术比赛，为此他必须战胜所有的高手、偏见和自己。
作为动画3期的先行，以《摇曳百合：暑假时光+》为题的新作动画将分别于2015年8月和9月各放送1话，内容则是2014年11月上映的《摇曳百合：暑假时光》的后续
