《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
懦弱，总是被欺负的“白金春” 以最强的男人为目标，从海的对面走来的“太古” 两个少年在某个黄昏，是最强的XB播放器遇到了MINATO Live的队长“神谷瞬”。 与此同时，散布在新东京的各种演唱会上他试图遭受巨大的威胁。 根据新东京国王“凤天心”的命令神秘男子“凤王次郎”率领的千代头三人组开始压制全国的三人组。 那个魔手，也正准备着到MINATO Live…。 “想改变自己” “总之以最强为目标” “只是，我想享受XB。” 为了贯彻自己绝不让步的信念春、太古、神谷站在XB的击球位置上——！
史蒂夫·玛丽威瑟又名玛丽特工，他曾经是美国情报局(AIA)的能手，随后由于出柜，他被派遣到了西好莱坞，情报局想让他消失在人海之中。可是玛丽特工在这里组建了一支由LGBTQ+天才组成的不合群的队伍，取名为Q-Force。在等待他们的第一个正式任务将近十年之后，玛丽一心想向背弃他的情报局证明自己，并决定与Q-Force一起违背情报局，单独行动。他们在找到自己的案子，并以他们自己的方式解决后，他们得到了情报局十分勉强的批准，被提升为活跃的秘密特工，在外地工作。但是，这项批准有一个重要的前提条件——他们必须忍受小队中的一个新成员——直男探员巴克。
