在火焰魔女事件之后，莫凡再次投入到魔都学府的修炼中，但就在最关键的时刻，突然传来了好兄弟张小候失踪的消息。重感情的莫凡立即停止赛程，带着魔都血族好友柳茹共同赶赴古都，闯入了正处于妖魔活跃期的中心地带。
今年，大学新鲜人泽木惣右卫门直保（坂口大助 配音）进入农业大学农学部，开始了全新的大学生活。其貌不扬的直保有一个天大的秘密，他能够看见存在于空气中的“菌”，甚至能够徒手抓住菌以及与其对话，这样的超能力对于农业专业的直保来说，无疑是如虎添翼，但是，麻烦也随之而来。 作为直保的亲梅竹马，直保的秘密无疑为家中经营酿酒行业的结城萤（斋贺观月 配音）创造了不少的便利。同时，外表意外老成的学长美里熏（小西克幸）和各方面都圆滚滚的川滨拓马（杉山纪彰 配音）都对直保产生了浓厚的兴趣。在崭新的校园里，直保和各式各样的菌在一起的生活就这样开始了。
在绿草甜美、宁静安和的青青草原，生活着一群无忧无虑的小白羊。聪明伶俐的喜羊羊（祖丽晴 配音）、美丽可爱的美羊羊（邓玉婷 配音）、懒惰贪吃的懒羊羊（梁颖 配音）、莽撞正义的沸羊羊（刘红韵 配音）、忠厚安静的暖羊羊（邓玉婷 配音），这群小家伙每天聚在一起，过着快乐的生活。而在森林另一端的黑色古堡里，住着邪恶狡猾的灰太狼（张琳 配音）和他暴戾无常的老婆红太狼（赵娜 配音）。灰太狼每天都要在老婆平底锅的敲打下前往羊村抓羊羊，羊村戒备森严，因此他想处种种办法，更发明许多奇形怪状的工具，然而最终总被机敏的小羊们挫败。 小羊和灰狼的战争就这样每天在青青草原上上演……
